抽脊髓液主要是用于檢查中樞神經系統感染性疾病，比如細菌性腦炎，病毒性腦炎，蛛網膜下腔出血等。
1、細菌性腦炎，是指細菌感染累及到腦膜所致的炎癥，表現為劇烈頭痛、發熱以及腦膜刺激征，包括頸項強直、克氏征陽性、布氏征陽性等，抽脊髓液可見腦脊液多核細胞數、蛋白含量升高，氯化物降低等，細菌性腦膜炎通常好發于兒童和嬰幼兒，臨床表現主要是發熱、寒顫、頭痛、嘔吐等癥狀，嚴重的情況下，還會導致偏癱、失語。
2、病毒性腦炎，是病毒透過血腦屏障感染到中樞神經系統，累及腦部所引起的炎癥性疾病。患者往往表現為頭痛、發熱，有高顱壓癥狀時惡心、嘔吐明顯。查體有頸項強直，克氏征和布氏征陽性。抽脊髓液可以發現腦脊液壓力增高，細胞數明顯高于正常，蛋白可部分升高。最常見的病毒是單純皰疹病毒，其他像帶狀皰疹病毒、巨細胞病毒、人類免疫缺陷病毒等也經常會感染到腦部。
3、蛛網膜下腔出血，分為自發性的和繼發性的。自發性的稱為動脈瘤性的蛛網膜下腔出血，是指動脈瘤破裂后，血流入到蛛網膜下腔，包括顱骨、硬膜、蛛網膜和腦，導致這幾個層面出血。繼發性的主要是指外傷導致的蛛網膜下腔出血，外傷以后腦組織會挫裂，導致一些血管破裂，破裂以后，血液就會進入到蛛網膜下腔。蛛網膜下腔出血在抽腦脊液時，會表現為均勻血性腦脊液。
